健康是体现社会经济发展水平的重要标志之一，由健康缺失导致的疾病，尤其是传染病，对社会经济发展的影响日益加重。传染病的发生是其自身的流行机制与自然、社会环境因素相互作用的结果，掌握其空间、时间分布特征及变化规律，可为公共卫生决策提供理论依据。 以全国31个省（直辖市、自治区）2004-2010年的39种法定传染病为对象，首先从时间尺度分析7年间全国范围内传染病发病率的时序变化趋势，并揭示主要传染病构成；其次，对各省传染病发病率时序变化进行聚类分析，揭示空间聚集特征；然后，通过主要传染病的全局、局部空间自相关分析，揭示传染病发病率在全国范围内的空间分布特征及其动态变化；最后，运用经验正交函数分析，定量描述主要传染病的时空动态变化过程和特征。主要结论为：(1)2004-2010年在全国范围内传染病总体发病率呈上升趋势，各类传染病发病率水平有明显差异，且变化趋势不同；(2) 我国传染病发病率的变化趋势存在显著的空间聚集性和差异性；(3)7年来，全国传染病空间差异减小，主要传染病类型的空间差异均不明显；肺结核的聚集性不断增强，范围不断扩散；(4)肺结核发病率在西部较高、东部较低，这种空间格局在7年间没有发生明显变化。