中文题名: | 不同癌症基因组中转录因子变异差异的分析 |
姓名: | |
保密级别: | 公开 |
论文语种: | 中文 |
学科代码: | 071001 |
学科专业: | |
学生类型: | 学士 |
学位: | 理学学士 |
学位年度: | 2019 |
学校: | 北京师范大学 |
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第一导师姓名: | |
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提交日期: | 2019-05-24 |
答辩日期: | 2019-05-15 |
中文关键词: | |
中文摘要: |
转录因子是细胞内重要的调控蛋白质。失调的转录因子参与了的诸多人类疾病的发病机制,包括糖尿病、炎症、心血管疾病和癌症等。了解转录因子的分子生物学意义,将提供疾病治疗的思路。本文通过生物信息学与统计学的手段,研究了TCGA数据库中乳腺癌与肺腺癌的转录因子变异分布的差异。结果发现,在两种不同癌症和同种癌症中,变异对转录因子蛋白的影响不同:二者错义突变、沉默突变、内含子突变等突变的比例明显不同;在8号、17号、18号、20号等染色体上的变异分布不同;约1/3的转录因子家族在两种癌症中的变异的比例不同,如zf-C2H2、Homeobox家族。并且,在乳腺癌中,有25个家族的转录因子变异占比与80%的其他家族不同;在肺腺癌中,这个数量为41个,其中也包含了zf-C2H2、Homeobox家族。这样的结果启发我们,在进一步探究癌症之间的异质性时,不能忽略这些有差异的转录因子。
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外文摘要: |
Transcription factors are important part of regulation of gene expression. They recognize specific DNA sequence control transcription. In this paper, we analyzed differences of transcription factors' mutation between breast cancer and lung adenocarcinoma in TCGA database and find that mutations of each transcription factor family and chromosome ratio in different cancers have significant variance. This result inspires us that we cannot neglect these kinds of transcription factors when discuss heterogeneity in cancers.
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参考文献总数: | 20 |
插图总数: | 11 |
插表总数: | 7 |
馆藏号: | 本071001/19024 |
开放日期: | 2020-07-09 |